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BioC 2020:软件和生物连接的地方

时间:2020年7月27 - 31日
什么:社区/开发者日,主要会议
地点:虚拟会议
松:Bioconductor团队(# bioc2020频道)
Twitter:# bioc2020

议程

所有时间都是美国东部时间。所有课程包括问答时间。

时间 追踪 的名字
周一,7/27/2020
8点我 社区 开放的早餐会
上午8:30 说话 演讲,马丁·摩根,介绍和欢迎
早上9点 说话 主旨,拉斐尔•伊。单细胞RNA-seq数据的概率基因表达特征
早上10点 说话 发言1,王毅,黄婷,Simina Boca, philippe Boilleau
上午11 车间 100: Levi Waldron,《Bioconductor》公共数据资源
下午12点 社区 物以类聚:关于可理解和可解释可视化的标准
下午12点 社区 与BioC核心团队进行交流
下午一点 车间 100: Chloe Mirzayi,流行病学概念研讨会
下午2点 车间 100: John Lawson,注释可可样品间DNA甲基化和ATAC-seq变异
下午三点 车间 100:Leonardo Collado-Torres,来自讲台的人类RNA-SEQ数据和相关包
下午4点 车间 100: James W. MacDonald,生物导体注释资源介绍
下午5点 车间 100: Stefano Mangiola, RNA-Seq分析的转录组学介绍
周二,7/28/2020
8点我 社区 开放的早餐会
早上9点 车间 200: Ludwig Geistlinger,高通量组学数据的功能富集分析
早上10点 车间 200: Haibo Liu, ATAC-seq QC和数据分析最佳实践
上午11 车间 200: Ludwig Geistlinger, Marcel Ramos, Sehyun Oh, Bioconductor拷贝数变异分析
下午12点 社区 物以类聚,人以群分
下午12点 社区 与BioC技术咨询委员会交谈
下午一点 车间 200: Charlotte Soneson, Aaron Lun,使用iSEE实现摘要实验对象的交互式可视化
下午2点 说话 Keynote, Kylie Bemis,内存不足计算与物质
下午三点 说话 贡献演讲2,Daniel Bunis, Koen Van den Berge, F. William Townes。劳伦许
下午4点 车间 200: Lihua Julie Zhu, Jianhong Ou, CRISPRseek为CRISPR基因组编辑系统设计靶标特异性gRNAs,包括base editor和prime editor
下午5点 车间 200: Kai Hu集成芯片序列数据分析车间
周三,7/29/2020
8点我 社区 BioC社区咨询委员会的介绍
首度在 社区 颁奖典礼
早上9点 说话 Keynote, Corrie Painter, Count Me In,与患者合作加快癌症研究的步伐
早上10点 社区 物以类聚:CDSB社区会议
上午11 车间 200: Marcel Ramos, MultiAssayExperiment and策展tcgadata Bioconductor 2020 workshop
下午12点 海报 海报会议
下午一点 车间 200: Aedin Culhane, Lauren Hsu,矩阵分解,svd和主成分分析的介绍
下午2点 说话 主旨演讲,陈飞,幻灯片:一个理解组织中细胞电路的平台
下午三点 说话 演讲3,Lukas M. Weber, Dario Righelli, Lambda Lu, Ellis Patrick
下午4点 车间 200: Petr Smirnov, Arvind Mer, Christopher Eeles,一个发现生物标志物的研讨会
下午5点 车间 用于CWL中可重复生物信息管道的使用和开发的Bioconductor工具链
周四,7/30/3030
8点我 车间 500: Peter F. Hickey,有效地使用DelayedArray框架来支持大型数据集的分析
早上9点 车间 100: Sehyun Oh, Levi Waldron,使用Terra/AnVIL基于云的基因组学
早上10点 车间 500: Mikhail Dozmorov,从多个Hi-C数据集中检测差异相互作用的染色质区域
上午11 车间 500: Kayla Interdonato,关于如何创建和提交一个包到Bioconductor的材料
下午12点 社区 物以类聚:在生物信息学研究中蓬勃发展的10条简单规则
下午12点 社区 与BioC核心团队进行交流
下午一点 说话 闪电谈话(第2阶段)
下午2点 说话 Keynote, X Shirley Liu,肿瘤蛋白降解的计算模型
下午三点 说话 贡献对话4,Anthony Mammoliti, shrada Pai, Gabriel Odom。露丝施密特
下午4点 车间 500: Anthony Federico,高效、可扩展、可重复的浓缩工作流
下午4点 社区 物以类聚:关于可理解和可解释可视化的标准-后续
下午5点 车间 200: Michael Love,导入alevin scRNA-seq计数到R/Bioconductor
周五,7/31/2020
8点我 海报 海报会议B
早上9点 说话 主讲人,Caroline Uhler,多领域数据集成:从观察到机制的见解
早上10点 说话 5、Emma Jablonski, Shian Su, Hena Ramay, Jayaram Kancheria
上午11 车间 500: Kelly Street, Koen Van den Berge,不同条件下的轨迹推断:差异表达和差异进展
下午12点 社区 物以类聚:用于集成计算工作流的可再现环境
下午12点 社区 与BioC核心团队进行交流
下午一点 说话 闪电会谈
下午2点 说话 Keynote, Aaron Lun, Making the infrastructure sausage: Bioconductor package development的故事
下午三点 说话 贡献演讲6,Charlotte Soneson, Davide Risso, Anthony Sonrel, Stephanie Hicks
下午4点 说话 闭幕词
下午四点半 快乐时光