| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| ABarray | 孙永明 | 应用生物系统基因组调查微阵列(AB1700)基因表达数据的微阵列QA和统计数据分析。 |
| affy | 拉斐尔·a·伊瑞扎里 | Affymetrix寡核苷酸阵列方法 |
| affycomp | 拉斐尔·a·伊瑞扎里 | 非词形表达度量评估的图形工具箱 |
| affycoretools | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 对使用Affymetrix基因芯片进行重复分析有用的函数。 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | 使用limma包进行affy分析的GUI |
| affypdnn | 劳伦特 | 探测affy包的依赖近邻(PDNN) |
| affyPLM | 本Bolstad | 探针级模型的拟合方法 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 替代cdfenvs |
| applera | 弗朗西斯卡Cordero | applera |
| aroma.light | 亨利克·本特松 | 仅使用基本R数据类型的微阵列数据规范化和可视化的轻量级方法 |
| arrayMagic | Andreas Buness | 双色cDNA阵列质量控制及预处理 |
| beadarray | 马克·邓宁 | BeadArrays的质量控制和低级分析 |
| beadarraySNP | 1月东 | Illumina SNP珠阵列的规范化和报告 |
| BeadExplorer | 加雷斯·维奇 | Illumina BeadChip数据的QC、标准化、注释和探索 |
| cellHTS | Ligia胸罩 | 细胞筛选分析 |
| codelink | 迭戈Diez | Codelink生物阵列数据的操作。 |
| gcrma | z吴 | 利用序列信息进行背景调整 |
| genArise | 国际金融公司发展小组 | 微阵列分析工具 |
| Harshlight | 莫里吉奥Pellegrino | 一种微阵列芯片的“校正化妆”程序 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | 用于limma包的GUI |
| LMGene | 李根哲 | 用于基因表达阵列中差异表达基因的数据转换和鉴定的LMGene软件 |
| maCorrPlot | 亚历山大plone ( | 可视化微阵列数据中的人工相关性 |
| makecdfenv | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | CDF环境生成器 |
| 庄园 | 皮埃尔Neuvial | CGH微阵列归一化 |
| marray | 杨怡华(Jean) | 双色斑点微阵列数据的探索性分析 |
| mmgmos | Xuejun刘 | 寡核苷酸信号的多芯片修正γ模型 |
| nnNorm | Tarca Laurentiu | 基于鲁棒神经网络的cDNA微阵列数据的空间和强度归一化 |
| 奥林 | 马提亚Futschik | 优化的局部强度相关的双色微阵列归一化 |
| OLINgui | 马提亚Futschik | OLIN的图形用户界面 |
| 罗摩 | 拉斐尔Gottardo | 微阵列的稳健分析 |
| SAGx | 每Broberg | 基因芯片的统计分析 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| snapCGH | 迈克•史密斯 | aCGH数据的分割、归一化和处理。 |
| spotSegmentation | 克里斯Fraley | 微阵列光斑块的分割与网格化 |
| stepNorm | 肖渊源 | cDNA芯片的逐步归一化函数 |
| tilingArray | w·休伯 | 高密度寡核苷酸平铺阵列分析 |
| vsn | 沃尔夫冈•休伯 | 微阵列数据方差稳定与校正 |