在在两个条件下观察到的基因表达数据的典型微阵列设置中,局部假发现率描述了两个条件之间在两个条件之间差异表达基因的概率,鉴于其CorrResponding观察到的得分或P值水平。P值与局部错误发现率的最终曲线为清晰差异和清晰的非分辨率基因表达之间的暮光区提供了深入的了解。软件包暮光包含两个主要功能:函数twilight.pval对给定输入矩阵或表达式集的均值差异进行了两条条件测试,并计算基于置换的p值。功能暮光执行随机下坡搜索,以估计局部错误的发现率和效果大小分布。
作者 | Stefanie Scheid |
维护者 | Stefanie Scheid |
小插图(文档) |
软件包下载 |
||||||||
|
|
生物浏览 | |
---|---|
要看 | R,花纹,统计 |
建议 | Golubesets,VSN |
进口 | |
系统要求 | |
执照 | GPL 2.0版或更新 |
URL | http://compdiag.molgen.mpg.de/software/twilight.shtml |
依赖部 | OrderedList |
建议 |