exonmap

高水平的分析Affymetrix外显子数组的数据

提供高级功能阅读Affy .CEL文件,表型数据,然后计算简单的东西,比如fold-changes t检验等等。适用于细粒基因组注释的数据。

作者 米甲Okoniewski蒂姆•耶茨Crispin J·米勒
维护人员 米甲Okoniewski

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“exonmap”)

小插曲(文档)

包下载
INSTALL.pdf
exonmap.example.pdf
exonmap.pdf
源 exonmap_1.0.07.tar.gz
Windows二进制 exonmap_1.0.07.zip
OS X的二进制 exonmap_1.0.07.tgz

细节

biocViews
微阵列,OneChannel,预处理,转录,DataImport,统计数据,DifferentialExpression,注释,ReportWriting,可视化
取决于 R, affy、simpleaffy genefilter、RColorBrewer RMySQL, DBI,方法,钳子
建议
进口
SystemRequirements
许可证 GPL版本2或更高版本
URL //www.andersvercelli.com/, http://bioinformatics.picr.man.ac.uk
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