tilingArray
高密度寡核苷酸平铺阵列分析
该软件包提供了一些功能，可用于高密度平片微阵列数据(如Affymetrix基因芯片)的分析，以测量转录本丰度和结构。这个包的主要功能是:'segmentation'类，用于表示线性序列数据的分区。函数“segment”用于使用快速而准确的动态规划算法拟合分段常数模型，“confint”用于使用结构包计算置信区间。函数'plotAlongChrom'用于生成漂亮的图形。函数'normalizeByReference'用于从一组参考杂交中调整探针序列依赖的响应。
| 作者 |
沃尔夫冈·胡贝尔，约恩·托德林，马特·里奇 |
| 维护人员 |
w·休伯 |
要安装这个包，启动R并输入:
源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“tilingArray”)
细节
| biocViews |
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| 取决于 |
R，方法，Biobase, affy, RColorBrewer，网格，结构，vsn，基因过滤器，基因绘图仪，像素图 |
| 建议 |
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| 进口 |
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| SystemRequirements |
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| 许可证 |
艺术许可，2.0版 |
| URL |
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| dependsOnMe |
snapCGH |
| suggestsMe |
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