| 包裹 | 维护者 | 标题 |
|---|---|---|
| Affycoretools | 詹姆斯·W·麦克唐纳 | 对使用Affymetrix Genechips进行重复分析的人有用的功能。 |
| AffyExpress | Xuejun Arthur Li | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 替代CDFENV |
| 安菲 | 科林·史密斯 | Affymetrix生物元数据的注释工具 |
| Annbuilder | J. Zhang | 生物导体注释数据包构建器 |
| 注释 | Biocore团队C/O BIOC用户列表 | 微阵列的注释 |
| AnnotationDbi | Biocore团队C/O BIOC用户列表 | 注释数据库接口 |
| AnnotationTools | 亚历山大·库恩（Alexandre Kuhn） | 用平面文件数据库进行注释微阵列并执行跨物种基因表达分析。 |
| Biomart | Steffen Durinck | BiomArt数据库的接口（例如Ensembl，Wormbase，Gramene和Uniprot） |
| 类别 | 罗伯特绅士 | 类别分析 |
| Chromoviz | 圣金·金 | 基因表达数据的多模式可视化 |
| dyndoc | Biocore团队C/O BIOC用户列表 | 动态文档工具 |
| Ecolitk | 劳伦特 | 大肠杆菌的元数据和工具 |
| 外部图 | 克里斯平·米勒（Crispin Miller） | Affymetrix外显子阵列数据的高水平分析 |
| 鹅群 | 保罗·香农 | R和Java生物信息学计划之间的广播数据 |
| 生成 | Y. D'Aubenton-Carafa | R用于基因和序列分析 |
| Globalancova | R. Meister | 计算对组之间差异基因表达的全局测试 |
| 全球测试 | Jelle Goeman | 测试基因组与临床变量的关联 |
| gostats | 罗伯特绅士 | 操纵GO和微阵列的工具。 |
| Gotools | 艾格尼丝·帕奎特（Agnes Paquet） | 基因本体数据库的功能 |
| keggsoap | 罗伯特绅士 | 客户端肥皂访问kegg |
| 火柴盒 | Biocore团队C/O BIOC用户列表 | 用于对数组探针的序列匹配的工具 |
| NEM | 弗洛里安·马克维茨（Florian Markowetz） | 嵌套效应模型以重建表型层次结构 |
| pdinfobuilder | 文斯·凯里（Vince Carey） | 平台设计信息包装构建器 |
| Resourcerer | 姜张 | 从TIGR Resourcerer读取注释数据或将注释数据转换为生物导体数据PACAKGE。 |
| rmapper | VJ Carey | 接口mapper.chip.org |
| rsnpper | VJ Carey | chip.org :: snpper的接口用于SNP相关数据 |
| Semsim | Xiang guo | 基于基因本体的语义相似性度量 |
| 简单 | 克里斯平·米勒（Crispin Miller） | 非常简单的Affymetrix数据的高水平分析 |