这个R扩展的函数是为了基因表达阵列数据的交叉研究比较。用户需要的是基因表达矩阵,它们对应的基因id向量和其他有用的信息,它们可以是'list','matrix',' expresset '或'ExpressionSet'。主要函数是'mergeExprs',它将输入对象转换为合并格式的数据,这样就可以很容易地在不同的数据集中找到共同的基因。用函数incor计算相关系数。其他函数使用'modelOutcome'的输出图形化地显示结果,并交叉验证基因表达数据与存活的关联。
| 作者 | 钟小刚Leslie Cope Elizabeth Garrett Giovanni Parmigiani |
| 维护人员 | 于宁波钟 |
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源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“MergeMaid”)
小插曲(文档) |
包下载 |
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| biocViews | |
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| 取决于 | R,生存,生物碱,MASS,方法 |
| 建议 | |
| 进口 | |
| SystemRequirements | |
| 许可证 | GPL版本2或更高版本 |
| URL | http://astor.som.jhmi.edu/MergeMaid |
| dependsOnMe | metaArray |
| suggestsMe |