提供高级函数,用于读取Affy . cel文件、表型数据,然后用它计算简单的东西,如t检验、折叠变化等。大量使用affy库。还具有一些基本的散点图功能和机制,用于生成高分辨率的日志数字…
作者 | 克里斯宾·J·米勒 |
维护人员 | Crispin米勒 |
要安装这个包,启动R并输入:
源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“simpleaffy”)
小插曲(文档) |
包下载 |
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biocViews | |
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取决于 | R, affy, genfilter, Biobase,方法,utils, gcrma |
建议 | |
进口 | 方法,跑龙套 |
SystemRequirements | |
许可证 | GPL版本2或更高版本 |
URL | //www.andersvercelli.com, http://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/ |
dependsOnMe | affyQCReport, arrayQualityMetrics, exonmap |
suggestsMe | AffyExpress |