simpleaffy

非常简单的Affymetrix数据的高级分析

提供高级函数,用于读取Affy . cel文件、表型数据,然后用它计算简单的东西,如t检验、折叠变化等。大量使用affy库。还具有一些基本的散点图功能和机制,用于生成高分辨率的日志数字…

作者 克里斯宾·J·米勒
维护人员 Crispin米勒

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“simpleaffy”)

小插曲(文档)

包下载

QCandSimpleaffy.pdf
simpleAffy.pdf
simpleaffy_2.14.05.tar.gz
Windows二进制 simpleaffy_2.14.05.zip
OS X二进制文件 simpleaffy_2.14.05.tgz

细节

biocViews
取决于 R, affy, genfilter, Biobase,方法,utils, gcrma
建议
进口 方法,跑龙套
SystemRequirements
许可证 GPL版本2或更高版本
URL //www.andersvercelli.com, http://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/
dependsOnMe affyQCReport, arrayQualityMetrics, exonmap
suggestsMe AffyExpress