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此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅科斯莫。
生物导体版本:2.10
COSMO在例如可以代表普通转录因子绑定站点的共享主题中搜索一组未对准的DNA序列。该算法类似于MEME,而且还允许用户指定一组约束,即未知图案的位置权重矩阵必须满足。例如,这种约束可以包括跨未知主题的某些区域的信息内容上的限制,并且通常可以基于关于所讨论的转录因子的结构的先验知识来配制。未知的主题宽度,主题出现的分布(OOPS,ZOOPS或TCM)以及可以自适应地选择数据。
作者:奥利弗Bembom,Fabian allusser和Sandrine Dudoit
维护者:Oliver Bembom
引文(从R内,输入引文(“COSMO”)
):
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BROWSEVIGNETTES(“COSMO”)
PDF. | COSMO中DNA序列保守基序的监督检测 | |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 执照 |
Biocviews. | 序列术那软件 |
版本 | 1.22.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.0(R-2.5)(9年) |
执照 | 文件许可证 |
依靠 | r(> = 2.4.0),方法,实用,seqlogo. |
进口 | |
链接到 | |
建议 | cosmogui. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | http://cosmoweb.berkeley.edu/intro.html.http://www.bepress.com/sagmb/vol6/iss1/art8. |
取决于我 | cosmogui. |
进口我 | |
建议我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | cosmo_1.22.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | cosmo_1.22.0.zip.(32-&64位) |
Mac OS x 10.6(雪豹) | |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocumon-mirror/cosmo/tree/release-2.10 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/cosmo/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |