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FunciSNP
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这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅FunciSNP。
集成功能的非编码数据集与识别候选基因关联研究监管snp
Bioconductor版本:2.11
从GWAS FunciSNP集成信息,1000和染色质特征识别功能基因组SNP编码或非编码区域。
作者:西蒙·g·Coetzee西蒙< simoncoetzee.com >和Houtan Noushmehr博士< Houtan在usp.br >
维护人员:西蒙·g·Coetzee西蒙< simoncoetzee.com >
从内部引用(R,回车引用(“FunciSNP”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“FunciSNP”)
文档
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browseVignettes (“FunciSNP”)
| R脚本 | FunciSNP装饰图案 | |
| UCSC_genomeviewer_glioma.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释,DataImport,DataRepresentation,基础设施,SequenceMatching,软件 |
| 版本 | 1.1.8 |
| Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 2.14.0),ggplot2,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,FunciSNP.data |
| 进口 | AnnotationDbi,IRanges,Rsamtools(> = 1.6.1),rtracklayer(> = 1.14.1)、方法ChIPpeakAnno(> = 2.2.0),GenomicRanges,VariantAnnotation,plyr,org.Hs.eg.db,snpStats,ggplot2(> = 0.9.0),重塑(> = 0.8.4),尺度 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | 平行 |
| URL | http://coetzeeseq.usc.edu/publication/Coetzee_SG_et_al_2012/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | FunciSNP_1.1.8.tar.gz |
| Windows二进制 | FunciSNP_1.1.8.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/funcisnp/tree/release - 2.11 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/FunciSNP/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
