要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ beadarray”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Beadarray

此软件包适用于生物导体的2.11版;对于稳定的最新版本,请参阅Beadarray

Illumina Beadarray数据的质量评估和低级分析

生物导体版本:2.11

该软件包能够读取BeadScan输出的珠级数据(原始TIFFS和文本文件)以及Beadstudio的珠子 - 萨华数据。提供了质量评估和低级分析的方法。

作者:马克·邓宁,迈克·史密斯,乔纳森·凯恩斯,安迪·林奇,马特·里奇

维护者:Mark Dunning

引用(从r内,输入引用(“ Beadarray”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ beadarray”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Beadarray”)

PDF R脚本 beadarray.pdf
PDF R脚本 Beadlevel.pdf
PDF R脚本 Beadsummary.pdf
PDF R脚本 ImageProcessing.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件
版本 2.8.1
在生物导体中 Bioc 1.8(R-2.3)(10年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 2.13.0),生物基因(> = 0.3.2),生物酶(> = 2.17.8),方法,GGPLOT2
进口 Beaddatapackr,,,,林玛,,,,AnnotationDbi,stats4,生物基因,,,,RESHAPE2
链接
建议 Lumi,,,,VSN,,,,副词,,,,HWRITER,,,,Beadarrayexampledata,,,,Illuminahumanv3.db,,,,栅格
系统要求
增强
URL
取决于我 Beadarrayexampledata
进口我 ArrayQualityMetrics,,,,Beadarrayusecases
建议我 Beadarraysnp,,,,Lumi
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 beadarray_2.8.1.tar.gz
Windows二进制 beadarray_2.8.1.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/beadarray/tree/release-2.11
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/beadarray/
软件包下载报告 下载统计

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生物导体

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户
弗雷德·哈钦森癌症研究中心