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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“chipseq”)
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chipseq
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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅chipseq。
为分析chipseq chipseq:一个包的数据
Bioconductor版本:2.12
工具帮助chipseq实验过程短的读取数据
作者:Deepayan Sarkar,罗伯特先生,迈克尔•劳伦斯Zizhen姚明
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“chipseq”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“chipseq”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“chipseq”)
| R脚本 | 一个示例ChIP-Seq分析工作流 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ChIPseq,软件 |
| 版本 | 1.10.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.5 (r - 2.10)(6.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(> = 2.10),方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),IRanges(> = 1.13.4),GenomicRanges(> = 1.7.7),BSgenome,ShortRead |
| 进口 | 方法,BiocGenerics,IRanges,BSgenome,GenomicRanges,晶格,ShortRead,统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | GenomicFeatures,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | 平 |
| 进口我 | HTSeqGenie |
| 建议我 | ggbio,oneChannelGUI |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | chipseq_1.10.1.tar.gz |
| Windows二进制 | chipseq_1.10.1.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | chipseq_1.10.1.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/chipseq/tree/release - 2.12 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/chipseq/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
