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安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“ensemblVEP”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
ensemblVEP
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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ensemblVEP。
R接口运用变异效果预测
Bioconductor版本:2.12
通过perl API查询运用变异效果预测
作者:瓦莱丽Obenchain < vobencha fhcrc.org >,
维护人员:瓦莱丽Obenchain < vobencha fhcrc.org >
从内部引用(R,回车引用(“ensemblVEP”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“ensemblVEP”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ensemblVEP”)
| R脚本 | ensemblVEP | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 自述 |
细节
| biocViews | 注释,生物信息学,软件 |
| 版本 | 1.0.5 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(3年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | 方法,BiocGenerics,GenomicRanges,VariantAnnotation |
| 进口 | Biostrings,IRanges |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | 运用(API版本73)和Perl包DBD:: mysql必须安装。看到包的README和运用网站http://www.ensembl.org/info/docs/variation/vep/index.html的安装说明。 |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | ensemblVEP_1.0.5.tar.gz |
| Windows二进制 | ensemblVEP_1.0.5.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | ensemblVEP_1.0.5.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/ensemblvep/tree/release - 2.12 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ensemblVEP/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
