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methyAnalysis
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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅methyAnalysis。
DNA甲基化数据分析和可视化
Bioconductor版本:2.12
methyAnalysis包DNA甲基化数据分析和可视化的目的。定义一个新类保持染色体的位置信息和数据。当前版本的包主要集中在分析Illumina公司英飞纳姆甲基化数组数据,但大多数方法可以推广到其他数组或甲基化测序数据。
作者:杜潘,理查德Bourgon
维护人员:杜潘< dupan。邮件在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“methyAnalysis”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“methyAnalysis”)
文档
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browseVignettes (“methyAnalysis”)
| R脚本 | 介绍methyAnalysis包 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DNAMethylation,微阵列,软件,可视化 |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(> = 2.10),网格,IRanges,Biobase(> = 2.5.5),org.Hs.eg.db |
| 进口 | 光民,methylumi,Gviz,genoset,GenomicRanges,IRanges,rtracklayer,GenomicFeatures,注释,Biobase(> = 2.5.5),AnnotationDbi,genefilter,biomaRt、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | IlluminaHumanMethylation450k.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | methyAnalysis_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | methyAnalysis_1.2.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | methyAnalysis_1.2.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/methyanalysis/tree/release - 2.12 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/methyAnalysis/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
