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triform
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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅triform。
Triform发现丰富地区(山峰)转录因子ChIP-sequencing数据
Bioconductor版本:2.12
Triform算法使用模范自由统计识别峰样分布的TF芯片测序读,利用一种改进的峰值定义结合已知剖面特征。
作者:卡尔Kornacker开发者(aut),托尼Handstad开发者(aut (cre)
维修工:托尼Handstad开发者<托尼。在gmail.com handstad >
从内部引用(R,回车引用(“triform”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“triform”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“triform”)
| R脚本 | Triform用户指南 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ChIPseq,测序,软件 |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 2.11.0),IRanges,yaml |
| 进口 | IRanges,yaml,BiocGenerics |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | triform_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | triform_1.2.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | triform_1.2.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/triform/tree/release - 2.12 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/triform/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
