要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506.
Bioconductor版本:2.12
从NCBI dbSNP Build 130中提取的智人SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2009年5月5日至6日创建,包含映射到参考基因组NCBI Build 36.1的snp,该基因组与UCSC的hg18基因组相同。因此,该包中的snp可以被“注入”到bsgenome . hspiens . ucsc中。Hg18,他们会降落在正确的位置。
作者:Herve Pages
维护:H. Pages
引文(从R内,输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens |
版本 | 0.99.8 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10),IRanges,GenomicRanges,BSgenome(> = 1.25.6) |
进口 | 方法,跑龙套,IRanges,GenomicRanges,BSgenome |
链接 | |
建议 | Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18(> = 1.3.19) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | ind1KG |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506_0.99.8.tar.gz |
Windows二进制 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506_0.99.8.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506_0.99.8.tgz |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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