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此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见BitSeq．

RNA-seq数据的转录本表达推断和差异表达分析

Bioconductor版本:2.13

BitSeq包主要用于RNA-seq数据的转录本表达分析和差异表达分析，分两阶段进行。在第一阶段，它使用贝叶斯推理方法从单个RNA-seq实验中推断单个转录本的表达。BitSeq的第二阶段包括转录本表达的差异表达分析。从多个条件的重复中提供表达估计，估计的对数正态模型用于推断条件的平均转录本表达，并根据差异表达的可能性对转录本进行排序。

作者:Peter Glaus, Antti Honkela和Magnus Rattray

维护者:Peter Glaus < Glaus at cs.man.ac.uk>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BitSeq”)

PDF	R脚本	BitSeq用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，HighThroughputSequencing，RNAseq，软件
版本	1.6.1
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(4年)
许可证	art -2.0 +文件许可
取决于	Rsamtools，zlibbioc
进口	IRanges
链接	Rsamtools，zlibbioc
建议	刨边机，DESeq
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	BitSeq_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	BitSeq_1.6.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	BitSeq_1.6.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/BitSeq/tree/release-2.13
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BitSeq/
软件包下载报告	下载数据