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CNAnorm
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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CNAnorm。
拷贝数差的归一化法癌症样本
Bioconductor版本:2.13
执行比例,GC含量校正和标准化的数据获得使用低覆盖率(一个阅读每100 - 10000 bp)高troughput测序。它执行一个“离散”正常化寻找基因组的倍性。它还将提供肿瘤内容如果可以找到至少两倍性状态。
作者:斯特凡诺拜里< sberri illumina.com >、亨利·m·伍德<莫莱森在leeds.ac木材。英国> Arief Gusnanto <。在leeds.ac.uk gusnanto >
维护人员:斯特凡诺拜里< sberri illumina.com >
从内部引用(R,回车引用(“CNAnorm”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“CNAnorm”)
文档
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browseVignettes (“CNAnorm”)
| CNAnorm.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 生物信息学,癌症,CopyNumberVariants,HighThroughputSequencing,肺,测序,软件 |
| 版本 | 1.8.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 2.10.1),DNAcopy、方法 |
| 进口 | 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.r-project.org |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | CNAnorm_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CNAnorm_1.8.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | CNAnorm_1.8.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/cnanorm/tree/release - 2.13 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/CNAnorm/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
