要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ diffbind”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的2.13版;对于稳定的最新版本,请参阅差异。
生物导体版本:2.13
使用亲和力(定量)数据从多个CHIP-SEQ实验中计算差异结合的位点。还可以实现占用(重叠)分析和绘制功能。
作者:Rory Stark
维护者:Rory Stark
引用(从r内,输入引用(“差异”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ diffbind”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ diffbind”)
R脚本 | 差异用户指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 生物信息学,,,,chipseq,,,,高通量序列,,,,软件 |
版本 | 1.8.5 |
在生物导体中 | Bioc 2.9(R-2.14)(4。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.15.0),基因组机 |
进口 | rcolorbrewer,,,,一张地图,,,,EDGER(> = 2.3.58),GPLOTS,grdevices,统计,utils,iranges,,,,Zlibbioc |
链接 | rsamtools |
建议 | deseq,,,,rsamtools,,,,deseq2 |
系统要求 | |
增强 | RGL, 平行 |
URL | |
取决于我 | MMDIFF |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | diffbind_1.8.5.5.tar.gz |
Windows二进制 | diffbind_1.8.5.5.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | diffbind_1.8.5.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/diffbind/tree/release-2.13 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/diffbind/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |