要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ harshlight”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

刺激性

该软件包适用于生物导体的2.13版;对于稳定的最新版本,请参阅刺激性

微阵列芯片的“矫正化妆”程序

生物导体版本:2.13

该软件包用于检测微阵列芯片上的扩展,扩散和紧凑的斑点。Harshlight会自动标记芯片集合(AffyBatch对象)中的区域,并返回校正后的AffyBatch对象,其中缺陷区域用NAS代替NAS或集合中其他芯片中同一探针的值中位数。新版本将替代值作为整个矩阵处理以解决内存问题。

作者:Mayte Suarez-Farinas,Maurizio Pellegrino,Knut M. Wittkowski,Marcelo O. Magnasco

维护者:毛里齐奥·佩莱格里诺(Maurizio Pellegrino)

引用(从r内,输入引用(“恶意”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ harshlight”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“刺激”)

PDF R脚本 刺激性
PDF 参考手册

细节

生物浏览 Affymetrixchip,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,报告写作,,,,软件
版本 1.34.0
在生物导体中 Bioc 1.9(R-2.4)(9。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 2.10)
进口 副词,,,,altcdfenvs,,,,生物酶,统计,utils
链接
建议
系统要求
增强
URL http://asterion.rockefeller.edu/harshlight/
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Harshlight_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 harshlight_1.34.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) Harshlight_1.34.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/harshlight/tree/release-2.13
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/harshlight/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户
弗雷德·哈钦森癌症研究中心