要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ harshlight”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的2.13版;对于稳定的最新版本,请参阅刺激性。
生物导体版本:2.13
该软件包用于检测微阵列芯片上的扩展,扩散和紧凑的斑点。Harshlight会自动标记芯片集合(AffyBatch对象)中的区域,并返回校正后的AffyBatch对象,其中缺陷区域用NAS代替NAS或集合中其他芯片中同一探针的值中位数。新版本将替代值作为整个矩阵处理以解决内存问题。
作者:Mayte Suarez-Farinas,Maurizio Pellegrino,Knut M. Wittkowski,Marcelo O. Magnasco
维护者:毛里齐奥·佩莱格里诺(Maurizio Pellegrino)
引用(从r内,输入引用(“恶意”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ harshlight”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“刺激”)
R脚本 | 刺激性 | |
参考手册 |
生物浏览 | Affymetrixchip,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,报告写作,,,,软件 |
版本 | 1.34.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.9(R-2.4)(9。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 2.10) |
进口 | 副词,,,,altcdfenvs,,,,生物酶,统计,utils |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://asterion.rockefeller.edu/harshlight/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | Harshlight_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | harshlight_1.34.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | Harshlight_1.34.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/harshlight/tree/release-2.13 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/harshlight/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |