要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ReportingTools")
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
该软件包适用于Bioconductor的2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ReportingTools。
Bioconductor版本:2.13
ReportingTools软件包使用户能够轻松显示从微阵列和测序数据等来源生成的分析结果报告。该软件包允许用户创建可以在Safari等网络浏览器上查看的HTML页面,或者以Excel等程序可读的其他格式查看。用户可以生成具有可排序和可筛选列的表,制作和显示图表,并将表格条目链接到其他数据源(如NCBI)或HTML页面中的更大的图表。使用该包,用户还可以生成目录页,将特定项目的各种报告链接在一起,这些报告可以在web浏览器中查看。
作者:Jason A. Hackney, Melanie Huntley, Jessica L. Larson, Christina Chaivorapol, Gabriel Becker, Josh Kaminker
维护者:Jason A. Hackney < Hackney。jason在gene.com>, Gabriel Becker在ucdavis.edu>
引用(来自R,输入引用(“ReportingTools”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ReportingTools")
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“ReportingTools”)
R脚本 | 微阵列差异表达的报道 | |
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参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,去,微阵列,RNAseq,软件,可视化 |
版本 | 2.2.0 |
在Bioconductor中 | BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | 方法,knitr |
进口 | Biobase,hwriter,类别,GOstats,limma(> = 3.17.5),晶格,AnnotationDbi,刨边机,注释,PFAM.db,GSEABase,BiocGenerics(>= 0.1.6),XML,R.utils,ggplot2,ggbio,DESeq2,IRanges |
链接 | |
建议 | RUnit,ggplot2,ggbio,所有,hgu95av2.db,org.Mm.eg.db,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | affycoretools |
建议我 | GSEABase |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
包的来源 | ReportingTools_2.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | ReportingTools_2.2.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | ReportingTools_2.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ReportingTools/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ReportingTools/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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