要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ReportingTools")

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

ReportingTools

该软件包适用于Bioconductor的2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ReportingTools

用于制作各种格式报告的工具

Bioconductor版本:2.13

ReportingTools软件包使用户能够轻松显示从微阵列和测序数据等来源生成的分析结果报告。该软件包允许用户创建可以在Safari等网络浏览器上查看的HTML页面,或者以Excel等程序可读的其他格式查看。用户可以生成具有可排序和可筛选列的表,制作和显示图表,并将表格条目链接到其他数据源(如NCBI)或HTML页面中的更大的图表。使用该包,用户还可以生成目录页,将特定项目的各种报告链接在一起,这些报告可以在web浏览器中查看。

作者:Jason A. Hackney, Melanie Huntley, Jessica L. Larson, Christina Chaivorapol, Gabriel Becker, Josh Kaminker

维护者:Jason A. Hackney < Hackney。jason在gene.com>, Gabriel Becker在ucdavis.edu>

引用(来自R,输入引用(“ReportingTools”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ReportingTools")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“ReportingTools”)

PDF R脚本 微阵列差异表达的报道
PDF R脚本 RNA-seq差异表达的报道
PDF R脚本 ReportingTools基础知识
PDF R脚本 ReportingTools闪亮的
超文本标记语言 R脚本 编织和报告工具
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学微阵列RNAseq软件可视化
版本 2.2.0
在Bioconductor中 BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,knitr
进口 Biobasehwriter类别GOstatslimma(> = 3.17.5),晶格AnnotationDbi刨边机注释PFAM.dbGSEABaseBiocGenerics(>= 0.1.6),XMLR.utilsggplot2ggbioDESeq2IRanges
链接
建议 RUnitggplot2ggbio所有hgu95av2.dborg.Mm.eg.dbknitr
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我 affycoretools
建议我 GSEABase
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源 ReportingTools_2.2.0.tar.gz
Windows二进制 ReportingTools_2.2.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) ReportingTools_2.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/ReportingTools/tree/release-2.13
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ReportingTools/
软件包下载报告 下载数据

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请阅读发布指南。将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

Fred Hutchinson癌症研究中心