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arrayQualityMetrics
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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅arrayQualityMetrics。
质量标准在微阵列数据集
Bioconductor版本:2.13
这个包生成微阵列数据质量度量报告在Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet AffyBatch)。报告包含通用和特定于平台的部分。1和2的颜色阵列平台都支持。
作者:沃尔夫冈·胡贝尔奥黛丽•考夫曼
维护人员:奥黛丽考夫曼< akauffmann。在gmail.com bioinfo >
从内部引用(R,回车引用(“arrayQualityMetrics”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“arrayQualityMetrics”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“arrayQualityMetrics”)
| R脚本 | 高级的主题:定制arrayQualityMetrics报告和编程处理输出 | |
| R脚本 | 简介:微阵列与arrayQualityMetrics质量评估 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 微阵列,OneChannel,质量控制,ReportWriting,软件,TwoChannel |
| 版本 | 3.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.1 (r - 2.6)(8.5年) |
| 许可证 | LGPL (> = 2) |
| 取决于 | |
| 进口 | affy,affyPLM(> = 1.27.3),beadarray,Biobase,开罗(> = 1.4 6),genefilter、图形grDevices、网格Hmisc,hwriter,晶格,latticeExtra,limma、方法、RColorBrewer,setRNG,simpleaffy统计,SVGAnnotation(0.9 > = 0),跑龙套,vsn(> = 3.23.3),XML |
| 链接 | |
| 建议 | ALLMLL,亚兰 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | arrayQualityMetrics_3.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | arrayQualityMetrics_3.18.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | arrayQualityMetrics_3.18.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/arrayqualitymetrics/tree/release - 2.13 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/arrayQualityMetrics/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
