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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“beadarray”)
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beadarray
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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅beadarray。
质量评估和低级Illumina公司BeadArray数据分析
Bioconductor版本:2.13
包能够读取bead-level数据(生口角和文本文件)输出BeadScan以及从BeadStudio bead-summary数据。质量评估方法和低层次的分析。
作者:马克·邓宁迈克史密斯,乔纳森•凯恩斯安迪•林奇马特里奇
维护人员:马克邓宁<马克。邓宁在cruk.cam.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“beadarray”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“beadarray”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“beadarray”)
| R脚本 | beadarray.pdf | |
| R脚本 | beadlevel.pdf | |
| R脚本 | beadsummary.pdf | |
| R脚本 | ImageProcessing.pdf | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,软件 |
| 版本 | 2.12.0 |
| Bioconductor自 | BioC 1.8 (r - 2.3)(10年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 2.13.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(> = 2.17.8)、方法ggplot2 |
| 进口 | BeadDataPackR,limma,AnnotationDbistats4,BiocGenerics,reshape2 |
| 链接 | |
| 建议 | 光民,vsn,affy,hwriter,beadarrayExampleData,illuminaHumanv3.db,gridExtra |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | beadarrayExampleData |
| 进口我 | arrayQualityMetrics,BeadArrayUseCases,epigenomix |
| 建议我 | beadarraySNP,光民 |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | beadarray_2.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | beadarray_2.12.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | beadarray_2.12.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/beadarray/tree/release - 2.13 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/beadarray/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
