要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("maDB")
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
该软件包适用于Bioconductor的2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见时间的。
Bioconductor版本:2.13
maDB允许创建一个简单的微阵列数据库来存储微阵列实验和注释数据。Affymetrix基因芯片的表达值以及两个彩色微阵列的值可以存储到数据库中。整个实验或实验子集(或微阵列子集中基因子集的值)可以提取回r。此外,maDB为微阵列数据分析提供了不同的实用功能,例如绘制MA图或火山图的功能,数据点根据局部点密度进行颜色编码,或允许复制处理微阵列的功能。
作者:Johannes Rainer < Johannes。Rainer在i-med。ac。at b>
维护者:Johannes Rainer < Johannes。Rainer在i-med。ac。at b>
引用(来自R,输入引用(“方法”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("maDB")
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“方法”)
时间- 015. - pdf | ||
时间- 016. - pdf | ||
maDB.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,软件,TwoChannel,可视化 |
版本 | 1.34.0 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(bbb11年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.6.0);Biobase(> = 2.5.5),affy(> = 1.23.4),pgUtils(> = 1.23.2),limma(>= 1.8.0),方法 |
进口 | |
链接 | |
建议 | annaffy(> = 1.6.2),biomaRt(> = 1.8.2),geneplotter |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
包的来源 | maDB_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6(雪豹) | maDB_1.34.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/maDB/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/maDB/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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