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seqCNA
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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅seqCNA。
癌症数据拷贝数高通量测序分析
Bioconductor版本:2.13
拷贝数快速癌症高通量测序数据的分析与总结,广泛筛选和改进的归一化
作者:大卫Mosen-Ansorena
维护人员:大卫Mosen-Ansorena < dmosen。gn在cicbiogune.es >
从内部引用(R,回车引用(“seqCNA”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
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文档
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| R脚本 | seqCNA | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 生物信息学,CopyNumberVariants,遗传学,HighThroughputSequencing,软件 |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 2.10),很高兴(> = 2.14),doSNOW(> = 1.0.5),adehabitatLT(> = 0.3.4),seqCNA.annot(> = 0.99),方法 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | samtools |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | seqCNA_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | seqCNA_1.2.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | seqCNA_1.2.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/seqcna/tree/release - 2.13 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/seqCNA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
