要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("siggenes")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见siggenes.
Bioconductor版本:2.13
利用微阵列显著性分析(SAM)和微阵列经验贝叶斯分析(EBAM)鉴定差异表达基因和估计错误发现率(FDR)。
作者:Holger Schwender
维护人员:Holger Schwender < Holger。等在gmx.de >
引用(从R中,输入引用(“siggenes”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("siggenes")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“siggenes”)
R脚本 | siggenes手册 | |
siggenesRnews.pdf | ||
超文本标记语言 | R: EBAM专用绘图法 | |
超文本标记语言 | R: EBAM专用打印方法 | |
超文本标记语言 | R: EBAM特定的汇总方法 | |
超文本标记语言 | R: FindA0特定的绘图方法 | |
超文本标记语言 | R: FindA0专用打印方法 | |
超文本标记语言 | R: SAM具体识别方法 | |
超文本标记语言 | R: SAM具体的绘图方法 | |
超文本标记语言 | R: SAM专用打印方法 | |
超文本标记语言 | R: SAM具体的总结方法 | |
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,ExonArray,GeneExpression,微阵列,MultipleComparisons,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 1.36.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 11年) |
许可证 | LGPL (> = 2) |
取决于 | 方法,Biobase,乘、样条函数、图形 |
进口 | stats4 |
链接 | |
建议 | affy,注释,genefilter,KernSmooth,scrime(> = 1.2.5) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | KCsmart,oneChannelGUI |
进口我 | 魅力,DeSousa2013,GeneSelector,minfi |
建议我 | GeneSelector,logicFS,三人组,XDE |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | siggenes_1.36.0.tar.gz |
Windows二进制 | siggenes_1.36.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | siggenes_1.36.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/siggenes/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/siggenes/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: