要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("siggenes")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

siggenes

此包适用于Bioconductor的2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见siggenes

使用SAM和Efron的经验贝叶斯方法进行多重测试

Bioconductor版本:2.13

利用微阵列显著性分析(SAM)和微阵列经验贝叶斯分析(EBAM)鉴定差异表达基因和估计错误发现率(FDR)。

作者:Holger Schwender

维护人员:Holger Schwender < Holger。等在gmx.de >

引用(从R中,输入引用(“siggenes”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("siggenes")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“siggenes”)

PDF R脚本 siggenes手册
PDF siggenesRnews.pdf
超文本标记语言 R: EBAM专用绘图法
超文本标记语言 R: EBAM专用打印方法
超文本标记语言 R: EBAM特定的汇总方法
超文本标记语言 R: FindA0特定的绘图方法
超文本标记语言 R: FindA0专用打印方法
超文本标记语言 R: SAM具体识别方法
超文本标记语言 R: SAM具体的绘图方法
超文本标记语言 R: SAM专用打印方法
超文本标记语言 R: SAM具体的总结方法
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpressionExonArrayGeneExpression微阵列MultipleComparisons单核苷酸多态性软件
版本 1.36.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 11年)
许可证 LGPL (> = 2)
取决于 方法,Biobase、样条函数、图形
进口 stats4
链接
建议 affy注释genefilterKernSmoothscrime(> = 1.2.5)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 KCsmartoneChannelGUI
进口我 魅力DeSousa2013GeneSelectorminfi
建议我 GeneSelectorlogicFS三人组XDE
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 siggenes_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 siggenes_1.36.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) siggenes_1.36.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/siggenes/tree/release-2.13
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/siggenes/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

弗雷德·哈钦森癌症研究中心