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安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“simpleaffy”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
simpleaffy
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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅simpleaffy。
非常简单的Affymetrix数据的高级分析
Bioconductor版本:2.13
提供高级功能阅读Affy .CEL文件,表型数据,然后计算简单的事情,如t、褶皱等变化。使大量使用affy库。也有一些基本的散点图功能和机制生成高分辨率数字杂志……
作者:Crispin J·米勒
维护人员:Crispin米勒< cmiller在picr.man.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“simpleaffy”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“simpleaffy”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“simpleaffy”)
| QCandSimpleaffy.pdf | ||
| R脚本 | simpleaffy底漆 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 自述 |
细节
| biocViews | 注释,生物信息学,DataImport,DifferentialExpression,微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,ReportWriting,软件,转录,可视化 |
| 版本 | 2.38.0 |
| Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R(> = 2.0.0)、方法、效用,grDevices,图形、统计,BiocGenerics(> = 0.1.12),Biobase,affy(> = 1.33.6),genefilter,gcrma |
| 进口 | 方法、跑龙套grDevices、图形数据,BiocGenerics,Biobase,affy,genefilter,gcrma |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | //www.andersvercelli.comhttp://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/ |
| 取决于我 | yaqcaffy |
| 进口我 | affyQCReport,arrayMvout,arrayQualityMetrics |
| 建议我 | AffyExpress,ArrayTools |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | simpleaffy_2.38.0.tar.gz |
| Windows二进制 | simpleaffy_2.38.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | simpleaffy_2.38.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/simpleaffy/tree/release - 2.13 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/simpleaffy/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
