安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19。
Bioconductor版本:2.13
智人(人类)全基因组提供的UCSC (hg19, 2009年2月)和存储在Biostrings对象。
作者:Bioconductor Dev团队
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”)
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens |
版本 | 1.3.19 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | BSgenome(> = 1.25.4) |
进口 | BSgenome |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | 嵌合体,FDb.InfiniumMethylation.hg19,motifRG |
进口我 | |
建议我 | ArrayTV,biovizBase,BSgenome,customProDB,FDb.FANTOM4.promoters.hg19,FDb.UCSC.snp135common.hg19,FDb.UCSC.snp137common.hg19,GenomicFeatures,GenomicRanges,ggbio,gmapR,Gviz,h5vc,MEDIPS,海市蜃楼,oneChannelGUI,r3Cseq,R453Plus1Toolbox,Rsamtools,RSVSim,rtracklayer,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20111119,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608,连接工具,VariantAnnotation |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19_1.3.19.tar.gz |
Windows二进制 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19_1.3.19.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19_1.3.19.tgz |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19/ |
包下载报告 | 下载数据 |