要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ArrayExpressHTS")

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

ArrayExpressHTS

该软件包适用于Bioconductor的2.14版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ArrayExpressHTS

ArrayExpress高通量测序处理管道

Bioconductor版本:2.14

RNA-Seq处理管道的公共ArrayExpress实验或本地数据集

作者:Angela Goncalves, Andrew Tikhonov

维护者:安吉拉·冈卡尔维斯< ebi.ac的电影>。>, Andrew Tikhonov < Andrew at ebi.ac.uk>

引用(来自R,输入引用(“ArrayExpressHTS”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ArrayExpressHTS")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“ArrayExpressHTS”)

PDF R脚本 ArrayExpressHTS:转录分析实验的RNA-Seq管道
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews RNASeq测序软件
版本 1.14.0
在Bioconductor中 BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证 艺术许可2.0
取决于 抽样Rsamtools(> = 1.3.32),
进口 BiobaseBiocGenericsBiostringsDESeqGenomicRangesHmiscIRangesR2HTMLRColorBrewerRsamtoolsShortReadXMLbiomaRt刨边机设备、图形、方法、rJava统计数据,svMisc跑龙套,sendmailRbitops
链接 Rsamtools
建议
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源 ArrayExpressHTS_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6(雪豹) ArrayExpressHTS_1.14.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) ArrayExpressHTS_1.14.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/ArrayExpressHTS/tree/release-2.14
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ArrayExpressHTS/
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