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此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见DESeq2．

基于负二项分布的差异基因表达分析

Bioconductor版本:2.14

基于使用负二项分布的模型，估计来自高通量测序测定的计数数据中的方差-均值依赖性，并检验差异表达

作者:Michael Love(波士顿HSPH)， Simon Anders, Wolfgang Huber(海德堡EMBL)

维护者:Michael Love

安装

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文档

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browseVignettes(“DESeq2”)

PDF	R脚本	使用“DESeq2”软件包分析RNA-Seq数据
PDF	R脚本	“DESeq2”包的初学者指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，DifferentialExpression，RNASeq，圣人，测序，软件
版本	1.4.5
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	GenomicRanges，IRanges，Rcpp(> = 0.10.1),RcppArmadillo(> = 0.3.4.4)
进口	BiocGenerics(>= 0.7.5)，方法locfit，genefilter，geneplotter，RColorBrewer，晶格
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	RUnit，gplots，knitr，Biobase，BiocStyle，parathyroidSE，pasilla(> = 0.2.10),DESeq，vsn，GenomicAlignments，GenomicFeatures，Rsamtools，biomaRt
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	DEXSeq，MLSeq，移行细胞癌
进口我	HTSFilter，phyloseq，ReportingTools
建议我	BiocGenerics，compcodeR，DiffBind，计
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	DESeq2_1.4.5.tar.gz
Windows二进制	DESeq2_1.4.5.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	DESeq2_1.4.5.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	DESeq2_1.4.5.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/DESeq2/tree/release-2.14
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DESeq2/
软件包下载报告	下载数据