要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“DMRcate”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

DMRcate

此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见DMRcate

Illumina 450K甲基化阵列空间分析方法

Bioconductor版本:2.14

利用Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip阵列数据对人类基因组中差异甲基化区域(DMRs)进行从头识别和提取。提供过滤可能被snp和交叉杂交混淆的探针的功能。包括床图生成,GRanges生成和绘图功能。

作者:蒂姆·彼得斯

维护者:Tim Peters

引文(从R内,输入引用(“DMRcate”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“DMRcate”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“DMRcate”)

PDF R脚本 DMRcate包使用指南
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DNAMethylationDifferentialExpressionDifferentialMethylationGeneExpression遗传学GenomeAnnotationMethylationArray微阵列MultipleComparisonOneChannel质量控制软件TimeCourseTwoChannel
版本 1.0.2中
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(2年)
许可证 文件许可
取决于 R (>= 3.1.0),limmaminfiDMRcatedata
进口 方法、图形
链接
建议 knitrRUnitBiocGenericsIlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19GenomicRanges
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 DMRcate_1.0.2.tar.gz
Windows二进制 DMRcate_1.0.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) DMRcate_1.0.2.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) DMRcate_1.0.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/DMRcate/tree/release-2.14
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/DMRcate/
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