要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“DMRcate”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见DMRcate.
Bioconductor版本:2.14
利用Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip阵列数据对人类基因组中差异甲基化区域(DMRs)进行从头识别和提取。提供过滤可能被snp和交叉杂交混淆的探针的功能。包括床图生成,GRanges生成和绘图功能。
作者:蒂姆·彼得斯
维护者:Tim Peters
引文(从R内,输入引用(“DMRcate”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“DMRcate”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“DMRcate”)
R脚本 | DMRcate包使用指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DNAMethylation,DifferentialExpression,DifferentialMethylation,GeneExpression,遗传学,GenomeAnnotation,MethylationArray,微阵列,MultipleComparison,OneChannel,质量控制,软件,TimeCourse,TwoChannel |
版本 | 1.0.2中 |
在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(2年) |
许可证 | 文件许可 |
取决于 | R (>= 3.1.0),limma,minfi,DMRcatedata |
进口 | 方法、图形 |
链接 | |
建议 | knitr,RUnit,BiocGenerics,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,GenomicRanges |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | DMRcate_1.0.2.tar.gz |
Windows二进制 | DMRcate_1.0.2.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | DMRcate_1.0.2.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | DMRcate_1.0.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/DMRcate/tree/release-2.14 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DMRcate/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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