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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“HTSeqGenie”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
HTSeqGenie
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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HTSeqGenie。
一个门店分析管道。
Bioconductor版本:2.14
库执行门店分析。
作者:格雷戈勒加索尔,延斯•里德
维护人员:Jens里德<里德。jens gene.com >
从内部引用(R,回车引用(“HTSeqGenie”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“HTSeqGenie”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“HTSeqGenie”)
| R脚本 | HTSeqGenie | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 软件 |
| 版本 | 3.14.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.0.0),gmapR(> = 3),ShortRead(> = 1.19.13),VariantAnnotation(> = 1.8.3) |
| 进口 | BiocGenerics(> = 0.2.0),IRanges(> = 1.14.3),GenomicRanges(> = 1.7.12),Rsamtools于(> = 1.8.5),Biostrings(> = 2.24.1),chipseq(> = 1.6.1),hwriter(1.3.0 > =版本),开罗(> = 1.5.5),GenomicFeatures(> = 1.9.31),BiocParallel、平行、工具rtracklayer(> = 1.17.19),GenomicAlignments,VariantTools(> = 1.3.6) |
| 链接 | |
| 建议 | TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,LungCancerLines,org.Hs.eg.db |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | HTSeqGenie_3.14.1.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
| Mac OS X 10.9(小牛) | |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/htseqgenie/tree/release - 2.14 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/HTSeqGenie/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
