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KEGGgraph
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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅KEGGgraph。
KEGGgraph:图方法在R和Bioconductor KEGG通路
Bioconductor版本:2.14
KEGGGraph KEGG通路之间的接口和图形对象以及一组工具来分析,剖析这些图形和可视化。它解析定期更新KGML (KEGG XML)文件到图模型属性维护所有必要的途径。包提供的功能包括解析、图形操作、可视化等。
作者:大卫•张Jitao保罗·香农的输入
维修工:Jitao大卫张< jitao_david。张在roche.com >
从内部引用(R,回车引用(“KEGGgraph”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“KEGGgraph”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“KEGGgraph”)
| R脚本 | KEGGgraph:应用实例 | |
| R脚本 | KEGGgraph: KEGG通路图方法 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GraphAndNetwork,通路,软件,可视化 |
| 版本 | 1.22.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.4 (r - 2.9)(7年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R(> = 2.10),方法,XML(2.3 > = 0),图 |
| 进口 | 方法,XML,图 |
| 链接 | |
| 建议 | Rgraphviz,RBGL,RUnit,RColorBrewer,KEGG.db,org.Hs.eg.db,hgu133plus2.db,SPIA |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.nextbiomotif.com |
| 取决于我 | pathview,ROntoTools,SPIA |
| 进口我 | 限幅器,DEGraph,NCIgraph |
| 建议我 | DEGraph,GenomicRanges |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | KEGGgraph_1.22.1.tar.gz |
| Windows二进制 | KEGGgraph_1.22.1.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | KEGGgraph_1.22.1.tgz |
| Mac OS X 10.9(小牛) | KEGGgraph_1.22.1.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/kegggraph/tree/release - 2.14 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/KEGGgraph/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
