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SomaticSignatures
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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SomaticSignatures。
体细胞签名
Bioconductor版本:2.14
SomaticSignatures包标识单核苷酸变异的突变特征(SNVs)。
作者:朱利安格林贝恩德•费舍尔(海德堡EMBL)的贡献
维护人员:朱利安格林<朱利安。格林在embl.de >
从内部引用(R,回车引用(“SomaticSignatures”)):
安装
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文档
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browseVignettes (“SomaticSignatures”)
| HTML | R脚本 | SomaticSignatures - HTML |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 癌症,聚类,GenomicVariation,HighThroughputSequencingData,PrinicpalComponent,测序,软件,SomaticMutation,StatisticalMethod,可视化 |
| 版本 | 1.0.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(2年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.0.2) |
| 进口 | GenomeInfoDb,GenomicRanges,IRanges,VariantAnnotation,Biostrings,ggplot2,ggbio,stringr,reshape2,NMF、方法、pcaMethods,gtools |
| 链接 | |
| 建议 | testthat,knitr,BiocStyle平行,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,SomaticCancerAlterations,h5vc,h5vcData,fastICA |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | //www.andersvercelli.com/packages/release/bioc/html/SomaticSignatures.htmlhttps://github.com/julian-gehring/SomaticSignatures |
| 取决于我 | |
| 进口我 | Rariant |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | SomaticSignatures_1.0.1.tar.gz |
| Windows二进制 | SomaticSignatures_1.0.1.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | SomaticSignatures_1.0.1.tgz |
| Mac OS X 10.9(小牛) | SomaticSignatures_1.0.1.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/somaticsignatures/tree/release - 2.14 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SomaticSignatures/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
