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TEQC
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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TEQC。
质量控制目标捕获实验
Bioconductor版本:2.14
目标捕获实验结合hybridization-based(在解决方案或微阵列)捕获感兴趣的和浓缩的基因组区域(如外显子组)的高通量测序DNA片段。这个包提供了评估和可视化功能的质量目标浓缩过程,捕获的特异性和敏感性,per-target读报道等等。
作者:m·胡默尔s Bonnin e·罗伊·g·罗马
维护人员:曼胡默尔< m。无角的在dkfz.de >
从内部引用(R,回车引用(“TEQC”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“TEQC”)
文档
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browseVignettes (“TEQC”)
| R脚本 | TEQC | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 遗传学,微阵列,质量控制,测序,软件 |
| 版本 | 3.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | 方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),IRanges(> = 1.13.5),Rsamtools,hwriter |
| 进口 | Biobase(> = 2.15.1) |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | TEQC_3.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TEQC_3.4.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | TEQC_3.4.0.tgz |
| Mac OS X 10.9(小牛) | TEQC_3.4.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/teqc/tree/release - 2.14 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/TEQC/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
