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魅力
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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅魅力。
DNA甲基化魅力微阵列数据的分析
Bioconductor版本:2.14
这个方案实现了对DNA甲基化分析工具生成的数据使用罗氏微阵列和McrBC协议。它发现样本之间的差异甲基化区域,计算百分比甲基化估计,包括数组质量评估工具。
作者:马丁·阿尔耶前来彼得村上,哈里斯贾菲,拉斐尔•伊
维护人员:彼得村上< pmurakam jhsph.edu >
从内部引用(R,回车引用(“魅力”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite(“魅力”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“魅力”)
| R脚本 | 魅力装饰图案 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DNAMethylation,微阵列,软件 |
| 版本 | 2.10.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.6 (r - 2.11)(6年) |
| 许可证 | LGPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 2.14.0),Biobase,SQN,字段,RColorBrewer,genefilter |
| 进口 | BSgenome,Biobase,益生元(> = 1.11.31),oligoClasses(> = 1.17.39),ff,preprocessCore、方法、统计数据Biostrings,IRanges,siggenes,nor1mix,gtoolsgrDevices,图形,跑龙套,limma平行,股东价值分析(> = 3.1.2) |
| 链接 | |
| 建议 | charmData,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18,corpcor |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | charmData |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | charm_2.10.1.tar.gz |
| Windows二进制 | charm_2.10.1.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | charm_2.10.1.tgz |
| Mac OS X 10.9(小牛) | charm_2.10.1.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/charm/tree/release - 2.14 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/charm/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
