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clusterProfiler
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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅clusterProfiler。
统计分析和visulization基因和基因的功能配置集群
Bioconductor版本:2.14
包实现方法分析和可视化功能配置(去和KEGG)的基因和基因集群。
作者:李亘Guangchuang Yu王
维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“clusterProfiler”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“clusterProfiler”)
文档
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browseVignettes (“clusterProfiler”)
| R脚本 | 介绍clusterProfiler | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类,去,GeneSetEnrichment,MultipleComparison,通路,软件,可视化 |
| 版本 | 1.12.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 2.10),ggplot2 |
| 进口 | 方法、stats4plyr,AnnotationDbi,GO.db,KEGG.db,剂量,GOSemSim |
| 链接 | |
| 建议 | org.Hs.eg.db,ReactomePA,pathview,knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://online.liebertpub.com/doi/abs/10.1089/omi.2011.0118 |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | ChIPseeker,剂量,GOSemSim,ReactomePA |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | clusterProfiler_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | clusterProfiler_1.12.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | clusterProfiler_1.12.0.tgz |
| Mac OS X 10.9(小牛) | clusterProfiler_1.12.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/clusterprofiler/tree/release - 2.14 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/clusterProfiler/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
