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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ggbio。

基因组数据的可视化工具。

Bioconductor版本:2.14

ggbio包扩展和专门的图形语法生物数据。图形是为了回答常见的科学问题,特别是那些经常问的高通量基因组学数据。支持所有核心Bioconductor数据结构,在适当的地方。包支持详细视图的特定基因组区域,以及全基因组概述。支持概述包括表意文字和大线性观点。高级阴谋包括序列片段长度,edge-linked间隔数据视图,不匹配的连环相撞,和几个拼接总结。

作者:腾飞阴,Dianne厨师,迈克尔·劳伦斯

维护人员:腾飞阴< yintengfei gmail.com >

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PDF	R脚本	0部分:介绍和快速启动
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,软件,可视化
版本	1.12.10
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics,ggplot2(> = 1.0.0)
进口	网格,grDevices、图形数据,跑龙套,biovizBase(> = 1.12.1),reshape2,gtable,Biobase,IRanges(> = 1.21.19),GenomicRanges(> = 1.13.3),GenomicFeatures,Rsamtools(> = 1.13.1),GenomicAlignments,BSgenome,gridExtra,尺度,VariantAnnotation,Hmisc,rtracklayer,Biostrings
链接
建议	vsn,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,chipseq,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,knitr,BiocStyle,Homo.sapiens
SystemRequirements
增强了
URL	http://tengfei.github.com/ggbio/
取决于我	咖啡馆,intansv
进口我	Rariant,ReportingTools,SomaticSignatures
建议我	beadarray,gwascat,interactiveDisplay,SomaticCancerAlterations
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	ggbio_1.12.10.tar.gz
Windows二进制	ggbio_1.12.10.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ggbio_1.12.10.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	ggbio_1.12.10.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/ggbio/tree/release - 2.14
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ggbio/
包下载报告	下载数据