要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ pathview”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

PathView

该软件包适用于生物导体的2.14版;对于稳定的最新版本,请参阅PathView

用于基于途径的数据集成和可视化的工具集

生物导体版本:2.14

PathView是用于基于路径的数据集成和可视化的工具集。它绘制并呈现有关相关途径图的各种生物学数据。所有用户都需要提供其数据并指定目标途径。PathView会自动下载Pathway Graph数据,解析数据文件,将用户数据映射到路径,并使用映射数据渲染路径图。此外,PathView还与途径和基因集(富集)分析工具无缝集成,用于大规模和完全自动化的分析。

作者:Weijun Luo

维护者:weijun luo

引用(从r内,输入引用(“ PathView”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ pathview”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ pathview”)

PDF R脚本 PathView:基于路径的数据集成和可视化
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,遗传学,,,,GraphandNetwork,,,,代谢组学,,,,微阵列,,,,途径,,,,蛋白质组学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,系统生物学,,,,可视化
版本 1.4.2
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(3年)
执照 GPL(> = 3.0)
要看 r(> = 2.10),kegggraph,,,,org.hs.eg.db
进口 rgraphviz,,,,图形,,,,PNG,,,,AnnotationDbi,,,,keggrest,方法,utils
链接
建议 量规,,,,org.mm.eg.db,,,,运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL http://pathview.r-forge.r-project.org/
取决于我
进口我
建议我 clusterProfiler,,,,量规,,,,Gagedata
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 pathview_1.4.2.tar.gz
Windows二进制 pathView_1.4.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) PATHVIEW_1.4.2.TGZ
Mac OS X 10.9(Mavericks) PATHVIEW_1.4.2.TGZ
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/pathview/tree/release-2.14
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pathview/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户
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