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qpgraph
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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qpgraph。
逆向工程与qp-graphs的分子调控网络
Bioconductor版本:2.14
q-order偏相关图,简称qp-graphs,无向高斯图形马尔科夫模型由q-order部分相关性。他们是很有用的学习无向图形化高斯马尔可夫模型从数据集随机变量p的数量超过了可用的样本大小为n,例如,在微阵列数据的情况下,他们可以用来进行反向工程,生成分子调控网络。
作者:r . Castelo和a . Roverato
维护人员:罗伯特Castelo <罗伯特。在upf.edu castelo >
从内部引用(R,回车引用(“qpgraph”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“qpgraph”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“qpgraph”)
| BasicUsersGuide.pdf | ||
| R脚本 | 逆向工程使用qpgraph转录调控网络 | |
| R脚本 | 使用qpgraph模拟分子调控网络 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,GeneRegulation,GraphAndNetwork,微阵列,NetworkInference,通路,软件,转录 |
| 版本 | 1.20.2 |
| Bioconductor自 | BioC 2.4 (r - 2.9)(7年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.0.0) |
| 进口 | 方法、并行矩阵(> = 1.0),注释,图(> = 1.41.2),Biobase,GGBase,AnnotationDbi,mvtnorm,qtl,Rgraphviz |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,genefilter,org.EcK12.eg.db |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | rlecuyer,雪,类别,GOstats |
| URL | http://functionalgenomics.upf.edu/qpgraph |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 限幅器 |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | qpgraph_1.20.2.tar.gz |
| Windows二进制 | qpgraph_1.20.2.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | qpgraph_1.20.2.tgz |
| Mac OS X 10.9(小牛) | qpgraph_1.20.2.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/qpgraph/tree/release - 2.14 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/qpgraph/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
