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此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见pasilla．

数据包与每个外显子和每个基因的RNA-seq样本Pasilla敲除计数Brooks等，基因组研究2011。

Bioconductor版本:2.14

该软件包提供了从RNA-seq数据中选择的基因计算的每个外显子和每个基因的读取数，这些数据出现在Brooks an, Yang L, Duff MO, Hansen KD, Park JW, Dudoit S, Brenner SE, Graveley BR, Genome res 2011 Feb;21(2):193-202, Epub 2010 10月4日，PMID: 20921232中。本实验研究了哺乳动物NOVA1和NOVA2的黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)同源基因Pasilla的RNAi敲低对转录组的影响。包插图描述了这里提供的数据如何来自RNA-Seq读取序列数据，该数据由NCBI基因表达Omnibus提供，登录号为GSM461176至GSM461181

作者:沃尔夫冈·胡贝尔，亚历杭德罗·雷耶斯

维护者:Alejandro Reyes < Reyes at embl.de>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“pasilla”)

PDF	R脚本	数据预处理和数据对象pasillaGenes和pasillaExons的创建
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData，RNAseqData
版本	0.4.0
许可证	LGPL
取决于
进口
链接
建议	locfit，刨边机，xtable，DEXSeq，DESeq
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	贝德，DESeq，DESeq2，DEXSeq，genefilter，GenomicRanges，pasillaBamSubset，ReportingTools
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	pasilla_0.4.0.tar.gz
Windows二进制	pasilla_0.4.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	pasilla_0.4.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	pasilla_0.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pasilla/
软件包下载报告	下载数据