安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“pasillaBamSubset”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

pasillaBamSubset

这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pasillaBamSubset

BAM的子集文件从“Pasilla”实验

Bioconductor版本:2.14

BAM文件untreated1子集。bam(单头读)和untreated3。bam (paired-end读取)从“Pasilla”实验(Pasilla混战,布鲁克斯et al .,基因组研究2011)。看到的小插图pasilla数据包如何untreated1 BAM文件。bam untreated3。bam RNA-Seq读取序列数据的获得是由NCBI基因表达综合下加入数字GSM461176 GSM461181。还包含飞4号染色体的DNA序列读取可以映射。

作者:h .页面

维修工:h .页< hpages fhcrc.org >

从内部引用(R,回车引用(“pasillaBamSubset”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“pasillaBamSubset”)

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews ExperimentData,RNAseqData
版本 0.2.0
许可证 LGPL
取决于
进口
链接
建议 pasilla
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 GenomicAlignments,GenomicFeatures,GenomicRanges,Rsamtools,TransView
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 pasillaBamSubset_0.2.0.tar.gz
Windows二进制 pasillaBamSubset_0.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) pasillaBamSubset_0.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛) pasillaBamSubset_0.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/pasillaBamSubset/
包下载报告 下载数据

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