Biostrings

字符串对象代表生物序列,和匹配算法

记忆有效字符串容器,字符串匹配算法,和其他公用事业、快速处理大量生物序列或一组序列。

作者 h .页面,r .绅士,p . Aboyoun和美国DebRoy
维护人员 h .页面

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“Biostrings”)

小插曲(文档)

包下载

Alignments.pdf
Biostrings2Classes.pdf
DNAStringVectorization.pdf
GenomeSearching.pdf
Biostrings_2.8.18.tar.gz
Windows二进制 Biostrings_2.8.18.zip
OS X的二进制 Biostrings_2.8.18.tgz

细节

biocViews
取决于 R,方法,统计数据
建议 BSgenome BSgenome.Celegans.UCSC。ce2 BSgenome.Dmelanogaster.UCSC。RUnit dm3、drosophila2probe hgu95av2probe
进口 方法,统计数据
SystemRequirements
许可证 艺术- 2.0
URL
dependsOnMe BSgenome、GGtools altcdfenvs
suggestsMe 注释、oneChannelGUI rtracklayer