GlobalAncova

计算组间差异基因表达的全局测试

我们给出了以下论据来支持GlobalAncova方法:在适当的规范化之后,基因表达数据看起来相当对称,异常值不是真正的问题,因此最小二乘应该相当稳健。具有相互作用的ANCOVA产生饱和数据模型,例如每组和基因的平均值不同。协变量调整有助于纠正可能的选择偏差。方差同质性和不相关残差是不可预期的。普通最小二乘的应用给出无偏估计,但不再是最优估计(高斯-马尔科夫-艾特肯)。因此,由于相关性,使用经典的f检验是不合适的。然而,检验统计量反映了原假设的偏差。结合排列方法,经验显著性水平可以近似。或者,近似产生渐近的p值。该研究得到了德国BMBF的NGFN拨款01 GR 0459的支持。

作者 U.曼斯曼,R.梅斯特,M.胡梅尔,R.舍菲尔,以及S.克努佩尔的贡献
维护人员 r·迈斯特

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