一种基于多芯片、多SNP方法的Affymetrix SNP阵列分类算法。利用已知基因型标签的大型训练样本,该算法将在新数据上获得更准确的分类结果。RLMM基于稳健的线性模型,并使用马氏距离进行分类。通过归一化去除芯片之间的非生物变异。这种基于模型的算法捕捉了基因型组和探针之间的相似性,以及数千个其他snp的精确分类。注意:100K-Xba目前仅在。
作者 | Nusrat Rabbee, Gary Wong报道 |
维护人员 | Nusrat Rabbee |
要安装这个包,启动R并输入:
源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“RLMM”)
文档 |
包下载 |
||||||||||||
|
|
biocViews | |
---|---|
取决于 |
R,质量 |
进口 | |
建议 | |
系统需求 | 内部文件Xba。CQV Xba。区域(或其他区域文件) |
许可证 | LGPL版本2或更新版本 |
URL | http://www.stat.berkeley.edu/users/nrabbee/RLMM |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
发展历史 | Bioconductor更新日志 |