nem

嵌套效应模型重建表型层次

“nem”包允许从微扰效应的嵌套结构中重建路径的特征。它将(1)一组受到干扰的通路成分,以及(2)这些扰动的高维表型读数(例如基因表达或形态谱)作为输入。输出是一个有向图,表示表型层次结构。

作者 Florian Markowetz, Holger Froehlich, Achim Tresch, Matthias Maneck, Claudio Lottaz, Tim Beissbarth
维护人员 Florian Markowetz

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源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite (nem)

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markowetz -论文- 2006. - pdf
嵌套效应模型——以果蝇免疫反应为例
参考手册
包的来源 nem_2.6.0.tar.gz
Windows二进制 nem_2.6.0.zip
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 nem_2.6.0.tgz
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 nem_2.6.0.tgz
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R, e1071;RgraphvizRBGL, time, cluster, bootstrap, RColorBrewer, plotrix
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许可证 GPL (>= 2)
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