| 包裹 | 维护者 | 标题 |
|---|---|---|
| Affycoretools | 詹姆斯·W·麦克唐纳 | 对使用Affymetrix Genechips进行重复分析的人有用的功能。 |
| AffyExpress | Xuejun Arthur Li | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 替代CDF环境（又称探针映射） |
| 安菲 | 科林·史密斯 | Affymetrix生物元数据的注释工具 |
| 注释 | Biocore团队C/O BIOC用户列表 | 微阵列的注释 |
| AnnotationDbi | Biocore团队C/O BIOC用户列表 | 注释数据库接口 |
| AnnotationTools | 亚历山大·库恩（Alexandre Kuhn） | 用平面文件数据库进行注释微阵列并执行跨物种基因表达分析。 |
| ArrayQualityMetrics | 奥黛丽·考夫曼（Audrey Kauffmann） | 微阵列数据集的质量指标 |
| Arraytools | 亚瑟·李 | Genechip分析软件包 |
| Biomart | Steffen Durinck | BiomArt数据库的接口（例如Ensembl，Wormbase和Gramene） |
| 类别 | 罗伯特绅士 | 类别分析 |
| 域名 | 弗洛里安·哈恩（Florian Hahne） | 基于基因域的基因富集 |
| dyndoc | Biocore团队C/O BIOC用户列表 | 动态文档工具 |
| Ecolitk | 劳伦特 | 大肠杆菌的元数据和工具 |
| 外部图 | 克里斯平·米勒（Crispin Miller） | Affymetrix外显子阵列数据的高水平分析 |
| 鹅群 | Dan Tenenbaum | R与其他生物信息学计划之间的广播数据 |
| Gene2Pathway | 霍尔格·弗罗希里奇（Holger Froehlich） | 基于Interpro域特征的单个基因的KEGG途径成员资格的预测 |
| 生成 | Y. D'Aubenton-Carafa | R用于基因和序列分析 |
| 生成 | 安托万·卢卡斯（Antoine Lucas） | 使用Viennarna包（折叠）的基因和序列的R |
| Globalancova | R. Meister | 计算对组之间差异基因表达的全局测试 |
| 全球测试 | Jelle Goeman | 测试基因组与临床变量的关联 |
| goprofiles | 亚历克斯·桑切斯（Alex Sanchez） | Goprofiles：用于功能剖面统计分析的R软件包 |
| Gosemsim | 广琴Yu | Go-Terms语义相似性度量 |
| gostats | 罗伯特绅士 | 操纵GO和微阵列的工具。 |
| Gotools | 艾格尼丝·帕奎特（Agnes Paquet） | 基因本体数据库的功能 |
| kegggraph | Jitao David Zhang | kegggraph：在R和bioconductor中使用的kegg途径的图形方法 |
| Keggorth | VJ Carey | KO，KEGG Orthology的图形支持 |
| keggsoap | 罗伯特绅士 | 客户端肥皂访问kegg |
| 火柴盒 | Biocore团队C/O BIOC用户列表 | 使用寡核苷酸微阵列记者序列信息进行预处理和质量评估的基本基础架构 |
| mirnapath | 詹姆斯·沃德 | mirnapath：miRNA表达数据的途径富集 |
| NEM | 基督教弯曲者 | 嵌套效应模型以重建表型层次结构 |
| Occugene | 奥利弗·威尔 | 多项式占用分布的功能 |
| Pannbuilder | 李洪 | 蛋白质注释数据包构建器 |
| pdinfobuilder | Benilton Carvalho | 平台设计信息包装构建器 |
| qpgraph | 罗伯特·卡斯特罗（Robert Castelo） | 用QP图纸的分子调节网络的逆向工程 |
| Resourcerer | 姜张 | 从TIGR Resourcerer读取注释数据或将注释数据转换为生物导体数据PACAKGE。 |
| rnaither | 诺拉·里伯（Nora Rieber） | 高通量RNAi屏幕的统计分析 |
| rtracklayer | 迈克尔·劳伦斯 | 基因组浏览器及其注释轨道的R接口 |
| 简单 | 克里斯平·米勒（Crispin Miller） | 非常简单的Affymetrix数据的高水平分析 |
| Xmapbridge | 蒂姆·耶茨（Tim Yates） | 导出将文件绘制到XMAPBRIDGE在X：MAP中可视化以进行可视化 |
| Yaqcaffy | 劳伦特·加托（Laurent Gatto） | Affymetrix表达数据质量控制和可重复性分析 |