| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| aCGH | 简Fridlyand | 阵列比较基因组杂交数据的类和函数。 |
| affxparser | 卡斯珀·丹尼尔·汉森 | Affymetrix文件解析SDK |
| affyio | 本杰明·米洛·博尔斯塔德 | 用于解析Affymetrix数据文件的工具 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | 使用limma包进行affy分析的GUI |
| ArrayExpress | 奥黛丽考夫曼 | 在EBI访问ArrayExpress Microarray数据库并构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch, NChannelSet |
| beadarraySNP | 1月东 | Illumina SNP珠阵列的规范化和报告 |
| codelink | 迭戈Diez | Codelink生物阵列数据的操作。 |
| ctc | 安东尼·卢卡斯 | 集群和树转换。 |
| exonmap | Crispin米勒 | Affymetrix外显子阵列数据的高水平分析 |
| GeneRegionScan | Lasse Folkersen | GeneRegionScan |
| genomeIntervals | 朱利安Gagneur | 基因组区间操作 |
| GEOquery | 肖恩·戴维斯 | 从NCBI基因表达Omnibus (GEO)获取数据 |
| 帮助 | 里德·f·汤普森 | 帮助数据分析工具 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | 用于limma包的GUI |
| makecdfenv | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | CDF环境生成器 |
| 庄园 | 皮埃尔Neuvial | CGH微阵列归一化 |
| 益生元 | Benilton卡瓦略 | 寡核苷酸阵列的低水平分析工具。 |
| oneChannelGUI | Raffaele A Calogero | 这个包扩展了affylmGUI图形界面的功能。Affymetrix 3’IVT，基因外显子阵列实际与Illumina、GEO矩阵系列文件和制表符分隔文件一起实现。 |
| 林格 | j . Toedling | 芯片-芯片寡聚阵列的研究 |
| rtracklayer | 迈克尔•劳伦斯 | R接口到基因组浏览器及其注释跟踪 |
| SAGx | 每Broberg | 基因芯片的统计分析 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| xps | 基督教Stratowa | 非对称寡核苷酸阵列包括外显子阵列，全基因组阵列和平板阵列的处理和分析 |