| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| AffyExpress | Xuejun阿瑟·李 | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | GUI使用limma affy分析包 |
| ArrayTools | 亚瑟•李 | geneChip分析包 |
| betr | 阿尔耶前来马丁 | 识别差异表达基因微阵列数据时间进程 |
| BGmix | 亚历克斯·列文 | 贝叶斯模型微分基因表达 |
| bgx | 欧内斯特Turro | 贝叶斯基因表达 |
| 桥 | 拉斐尔Gottardo | 贝叶斯强劲的推理微分基因表达 |
| 国王杯 | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 函数来执行癌症离群值剖面分析。 |
| daMA | Jobst Landgrebe | 高效的阶乘双色设计和分析微阵列数据 |
| DEDS | 肖渊源 | 微分表达式通过距离微阵列数据的总结 |
| DFP | 罗德里戈Alvarez-Glez | 基因选择 |
| diffGeneAnalysis | Choudary Jagarlamudi | 执行差异基因表达分析 |
| edd | 文斯凯里 | 表达密度诊断 |
| 刨边机 | 马克·罗宾逊戴维斯麦卡锡 | 数字在R基因表达数据的实证分析 |
| exonmap | Crispin米勒 | 高水平的分析Affymetrix外显子数组的数据 |
| factDesign | 丹尼斯Scholtens | 的阶乘设计微阵列实验分析 |
| fdrame | 有效率切尼克斯贝格 | 罗斯福调整微阵列实验(FDR-AME) |
| flagme | 马克。罗宾逊 | 代谢组学分析GC / MS数据 |
| gaga | 大卫Rossell | GaGa微阵列数据分析的层次结构模型 |
| GeneSelectMMD | Weiliang邱 | 基因选择基于基因资料的边际分布的特征是三分量的多元分布的混合物 |
| GeneSelector | 马丁Slawski | GeneSelector |
| GlobalAncova | r·迈斯特 | 计算全球测试组间差异基因表达 |
| globaltest | Jelle Goeman | 测试协会组织的基因与临床变量 |
| 哼哼 | HyungJun曹 | 非均匀误差模型在多种条件下的差异表达基因的识别 |
| lapmix | Yann Ruffieux | 拉普拉斯混合模型在微阵列实验 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | GUI对limma包 |
| LMGene | 约翰·蒂 | LMGene日期转换软件和识别差异表达基因的基因表达的数组 |
| logitT | 托拜厄斯Guennel | logit-t包 |
| 简述 | Nitin耆那教徒的 | 方法分析微阵列数据使用本地集中错误(简述)方法 |
| maanova | 基思·谢泼德 | 分析微阵列实验的工具 |
| macat | Joern Toedling | 微阵列染色体分析工具 |
| maigesPack | 古斯塔沃·h·斯特维斯 | 函数来处理互补脱氧核糖核酸微阵列数据,包括一些数据分析的方法 |
| maSigPro | 安娜Conesa | 显著的基因表达谱差异时间进程微阵列数据 |
| MergeMaid | 于宁波钟 | 合并女仆 |
| metaArray | 遭受崔 | 集成微阵列数据的荟萃分析 |
| metahdep | 约翰·r·史蒂文斯 | 分层的依赖在荟萃分析 |
| miRNApath | 詹姆斯·m·沃德 | miRNApath: microrna的表达数据的通路富集 |
| 乘 | 凯瑟琳·s·波拉德 | Resampling-based多重假设检验 |
| 推动 | n .院长 | 正常的统一微分基因表达检测 |
| OCplus | 亚历山大plone ( | 操作特征以及样本容量和本地罗斯福微阵列实验 |
| 益生元 | Benilton卡瓦略 | 低级的寡核苷酸阵列分析的工具。 |
| oneChannelGUI | 拉斐尔一Calogero | 这个包扩展affylmGUI图形界面的功能。Affymetrix 3 '看,基因外显子数组实际上是实现togheter Illumina公司,GEO矩阵系列文件和标签分隔的文件。 |
| OrderedList | 克劳迪奥·Lottaz | 相似基因的有序列表 |
| pcot2 | 莎拉的歌 | 主坐标和霍特林的丁字尺方法 |
| pickgene | 布莱恩·扬德尔 | 适应性基因芯片表达数据分析 |
| plgem | 诺曼·帕夫卡 | 幂律全局误差模型 |
| PLPE | Soo-heang Eo | 当地集中错误检测与配对的高通量数据微分表达式 |
| plw | 马格努斯搁浅地 | 调查当地主持加权t水平。 |
| 彪马 | 理查德·皮尔森 | 传播微阵列分析的不确定性 |
| RankProd | Fangxin香港 | 产品排名的方法识别差异表达基因在荟萃分析中的应用 |
| 中华民国 | 文斯凯里 | 中华民国的公用事业,uarray焦点 |
| SAGx | 每Broberg | GeneChip的统计分析 |
| siggenes | Holger Schwender | 多个测试使用萨姆和埃夫隆的经验贝叶斯方法 |
| sigPathway | Weil赖 | 路径分析 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| sscore | 理查德•肯尼迪 | S-Score算法Affymetrix寡核苷酸微阵列 |
| ssize | 格雷戈里·r·警告 | 样本量估计微阵列 |
| timecourse | 玉川泰 | 统计分析发育微阵列时间进程的数据 |
| 《暮光之城》 | 斯蒂芬妮Scheid | 估计当地的错误发现率 |
| webbioc | 科林·a·史密斯 | Bioconductor Web界面 |
| XDE | 罗伯特Scharpf | XDE:贝叶斯分层模型cross-study差异基因表达分析 |