| 包裹 | 维护者 | 标题 |
|---|---|---|
| AffyExpress | Xuejun Arthur Li | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| affylmgui | 基思·萨特利 | 使用Limma软件包进行AFFY分析的GUI |
| affyplm | 本·布尔斯塔德 | 拟合探针级模型的方法 |
| Affyqcreport | 克雷格·帕尔曼（Craig Parman） | QC报告生成affyBatch对象 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 替代CDF环境（又称探针映射） |
| arraymvout | V. Carey | 表达阵列QA的多元离群值检测 |
| 阵列 | 艾格尼丝·帕奎特（Agnes Paquet） | 评估斑点阵列的阵列质量 |
| ArrayQualityMetrics | 奥黛丽·考夫曼（Audrey Kauffmann） | 微阵列数据集的质量指标 |
| Arraytools | 亚瑟·李 | Genechip分析软件包 |
| Beadarray | 马克·邓宁 | Illumina Beadarray数据的质量评估和低级分析 |
| 染料 | 菲利普·利伊扎德（Philip Lijnzaad） | 校正基因特异性染料偏置的方法 |
| 帮助 | 里德·F·汤普森（Reid F. Thompson） | 帮助数据分析的工具 |
| 林玛 | 戈登·史密斯（Gordon Smyth） | 微阵列数据的线性模型 |
| 利马瓜 | 基思·萨特利 | limma套餐的GUI |
| 庄园 | 皮埃尔·诺维亚尔（Pierre Neuvial） | CGH微阵列归一化 |
| 奥林 | Matthias Futschik | 两色微阵列的优化局部强度依赖性归一化 |
| Olingui | Matthias Futschik | OLIN的图形用户界面 |
| Onechannelgui | Raffaele A Calogero | 该软件包扩展了AffylMGUI图形接口的功能。Affymetrix 3'ivt，基因和外显子数组实际上是用Illumina，Geo Matrix系列文件和选项卡划界文件实现的。 |
| 拉玛 | 拉斐尔·戈塔多（Raphael Gottardo） | 微阵列的强大分析 |
| 林戈 | J. Toedling | R调查芯片芯片寡聚架 |
| rnaither | 诺拉·里伯（Nora Rieber） | 高通量RNAi屏幕的统计分析 |
| 简单 | 克里斯平·米勒（Crispin Miller） | 非常简单的Affymetrix数据的高水平分析 |
| Spikeli | 恩里科·卡伦（Enrico Carlon） | Affymetrix Spike-In Langmuir等温数据分析工具 |
| 细分 | 克里斯·弗雷利（Chris Fraley） | 微阵列分割和微阵列块的网格 |
| Yaqcaffy | 劳伦特·加托（Laurent Gatto） | Affymetrix表达数据质量控制和可重复性分析 |